아테나는 영화 <신들의 전쟁>에서 인간에게 도움을 주는 여신이자 직접 타이탄 족과 용감하게 싸우다 전사(戰死)하는 여전사로 변용된다. 영화는 권력에 대한 탐욕으로 가득 찬 하이페리온 왕이 세상을 지배하기 위해 신들을 향해 전쟁을 선포하는 것으로 시작한다. 하이페리온 왕의 계략은 인류를 지배할 최고의 무기인 전설의 활 \'에피루스의 활\'을 손에 넣어 지하에 갇혀있는 타이탄 족을 깨어나게 해서, 이들이 올림포스의 신들과 싸우도록 하는 것이다. 타이탄 족이 올림포스의 신들을 물리쳐 준다면 세상은 자기가 지배할 수 있다는 전략이다. 이 때문에 올림포스 신들과 인간 세상은 극심한 혼돈에 빠진다. 올림포스의 신들은 인간의 전쟁에 관여할 수 없다는 올림포스의 규율 때문에 자신들이 직접 나서지도 못하고, 그렇다고 하이페리온 왕의 계략을 가만 놔둘 수도 없는 처지다. 그래서 결국 자신들을 대신 할 수 있는 인간인 테세우스를 신들의 전사로 추대한다. 테세우스는 신이 추대한 전사이자 불멸의 영웅으로 새롭게 깨어나 신과 인간 모두의 운명을 걸고 하이페리온 왕과 전쟁을 벌인다. 하지만 테세우스는 하이페리온 왕이 타이탄 족을 깨우는 것을 막지 못하고, 이 때문에 올림포스의 신들과 타이탄 족 사이에는 전쟁이 벌어진다. <신들의 전쟁>에서 아테나는 올림포스의 규율을 어기면서까지 영웅 테세우스가 하이페리온 왕과 대적하는 과정에 겪는 여러 가지 시련과 모험을 극복하는데 도움을 준다. 그리고 영화 마지막 부분에 등장하는 올림포스 신들과 타이탄 족의 전투에서는 직접 칼을 들고 싸우는 전사로 등장하며, 결국에는 타이탄 족에 의해 죽임을 당하는 존재로 나타난다. 원형콘텐츠에서는 전쟁을 주관하는 지혜의 여신, 불사(不死)의 여신으로 그려지지만, 영화에서는 타이탄 족에 맞서 싸우다 죽임을 당하는 유한한 생명의 여신으로 등장한다.