애니메이션의 프레이야는 주인공 치이를 돕는 조력형 인물로, 금단의 사랑에 괴로워하지만 진정한 사랑을 일깨워주는 여성이다. 인간과 유사한 신체구조를 지닌 일명 인간형 파소콘(퍼스널 컴퓨터)가 유행하는 가까운 미래의 일본. 시골에서 상경한 가난한 재수생 모토스와 히데키는 어느 날 쓰레기 더미에서 귀여운 소녀 모양의 컴퓨터를 줍는다. 긴 머리와 귀여운 얼굴을 한 소녀 파소콘은 OS(운영체제), 애플리케이션이나 데이터도 없고, \'치이~\'라고 말하기만 한다. 히데키는 그녀에게 \'치이\'(본명 엘다) 라는 이름을 붙여준다. 그녀는 히데키를 잘 따르고 말부터 모두 그에게 배우며 함께 산다. 하지만 점차 그녀가 보통 컴퓨터가 아닌 직접 사고하고 행동하는 전설의 파소콘인 ‘쵸비츠’인 것이 밝혀진다. 또한 그녀에게는 쌍둥이 언니인 프레이야(원형콘텐츠의 프레이야)가 있어 영혼의 상태로 치이에게 나타난다. 치이와 프레이야를 만든 미하라 이치로는 딸처럼 키우고자 프레이야를 만들었지만, 프레이야는 미하라를 사랑하게 되어 자신의 마음을 죽여야 하는 고통에 괴로워한다. 슬픔에 잠기는 프레이야를 위해 동생 엘다를 만들어주지만 점차 프레이야는 자신의 감정적인 무게를 못 이겨 고장이 나기 시작하고 스스로 시스템을 종료시키고자 한다. 동생 엘다는 언니를 보며 자신의 기억을 잃을 것을 각오하고 프레이야의 데이터를 받아들여 하나로 흡수하기로 결정한다. 받아들이기 전, 그녀는 아버지의 아내인 히비야에게 다시 미하라를 사랑하지 않기 위해 낯선 곳에 버려달라고 부탁한다. 엘다가 히데키 곁에서 ‘치이’가 되자 프레이야는 치이가 고민에 빠질 때 그녀와 동일한 모습으로 나타나 그녀가 자신만의 사람을 찾을 수 있도록 조언을 해준다. 또한 프레이야는 치이가 곤경에 있을 때 위로를 해주고, 점차 히데키에 대한 사랑의 감정을 이해할 수 있게 도와준다. 이런 프레이야는 치이가 사랑을 찾게끔 돕는다는 면에서 원형의 사랑의 여신의 역할을 따르고 있다. 하지만 금단의 사랑을 겪은 과거와 상처가 있는 그녀는 원형과 달리, 신화 속 일렉트라를 떠올리기도 한다. 그녀는 금단의 대상인 아버지를 사랑하여 스스로 파멸하는 자기 파괴적인 인물이나, 무의식과 내면을 반영하는 영혼으로 변화하는 입체적인 캐릭터이다. 원형에서 프레이와 남매관계였던 것과 달리 자매이며 또 다른 자아로서 정반대의 검은색을 입고 나타난다. 이를 통해 작품은 주인공 치이의 내면의 갈등에 집중하게 하며, 여기서 프레이야는 진정한 사랑을 알려주는 인물이다. 여신 프레이야는 원형과 반대로 도리어 인간에게 가르침을 받고, 인간의 지도와 프로그래밍에 따라 살아가는 존재로 급격히 변화한다. 하지만 그 중에서도 빼어난 기능과 자주적인 인격체를 지닌, 사랑을 할 수 있는 로봇에 가까운 존재로 변용된다.